促成陳醫師書寫這本“小說化歷史”（他個人不認為是“歷史小說”），起因於家族長輩一句「我們家的第一代查某祖是一位荷蘭女性」，促使醫師探尋十七世紀某些臺灣人的祖先。
小說寫作的背景為西元1646-1662年間的臺灣，當時島嶼為荷蘭人所掌管。書名的「三族」，所指的分別是當時居住在臺灣島上在地原住民、歐洲荷蘭白人以及中國漢人，作者分別以西拉雅女子烏瑪、荷蘭少女瑪利婭以及漢人將軍陳澤為「三族」代表，為小說故事展開鋪陳......
那是一個詭譎波動的時代，亞洲的大明帝國因腐敗而被大清王朝取代； 歐洲的大航海時代，也使得荷蘭與西班牙、葡萄牙搶奪地盤與資源貿易而疲於奔命； 然而，當時的台灣島仍是一任人來來去去的自由島嶼，島上的西拉雅族接待了荷人、漢人、清人， 反使自己被統治。每條生命都試圖盡量和平相處，但一旦有人覺得吃虧了，「非我族類，其心必異」 的猜忌與鬥爭而延伸的戰爭衝突則無法避免的現實難題。
作者於篇首豪情地寫下「為台灣留下歷史，為歷史記下台灣」， 揭示他為創作此書的目的。總使人喟嘆的是，「 人類歷史的可貴在於族群融合，而不在於戰爭。不幸的是，融合常須歷經戰爭才達成。」
